以成为神奇宝贝大师为目标，小智（松本梨香 配音）、小刚（うえだゆうじ 配音）和小光（豊口めぐみ 配音）带着各自的神奇宝贝在世界各地进行艰苦的修业之旅，今天他们历经长途跋涉终于来到了风景秀美的米琪亚镇。在当地一对小兄妹的介绍下，小智一行前往神殿遗址游玩。谁知却遭遇了极其危险的情况。关键时刻，掌管时间的迪亚鲁加和守卫神殿的西娜（北乃きい 配音）、凯宾（岸祐二 配音）帮助了他们，能与神奇宝贝心灵沟通的西娜还熄灭了冥王龙的怒火。从西娜口中得知，创造了世界的神奇宝贝即将苏醒，它不仅会使时空扭曲错乱，还将为世界带来毁灭性的灾难…… 本片为神奇宝贝系列第十二部电影剧场版。
演员：千叶繁 三矢雄二 西原久美子 神谷明 三田友子 佐久间玲 泷口顺平 笹冈繁藏 铃木胜美 石野龙三 山寺宏一 佐藤蓝 菅原淳一 藤本让 青森伸 南杏子 加藤精三 仲木隆司 水鸟铁夫 伊仓一惠 鹰森淑乃 本多知惠子 一龙斋贞友 西村知道 中原茂 小野健一 广濑正志 泽木郁也 二又一成 松井菜樱子 乡里大辅 北村弘一 饭塚昭三 长岛雄一 峰惠研 安西正弘 松本保典 堀内贤雄 盐屋浩三 古田信幸 折笠爱 若本规夫 小杉十郎太 西川几雄 大塚明夫 池本小百合 岛田敏 绪方贤一 大塚芳忠 泷泽久美子 池田胜 井上瑶
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